Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb2aQ7TMM9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms