Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ScocQ78YZ6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms