Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmed3Q78IS1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms