Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim37Q6PCX9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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