Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smchd1Q6P5D8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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