Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hdac10Q6P3E7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac10Q6P3E7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms