Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF0

Ocrl, Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1, mousemouse

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OcrlQ6NVF0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OcrlQ6NVF0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OcrlQ6NVF0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms