Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sohlh1Q6IUP1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sohlh1Q6IUP1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms