Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt40Q6IFX3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Krt40Q6IFX3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms