Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scaf8Q6DID3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms