Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms