Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ric1Q69ZJ7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ric1Q69ZJ7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ric1Q69ZJ7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ric1Q69ZJ7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ric1Q69ZJ7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ric1Q69ZJ7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ric1Q69ZJ7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ric1Q69ZJ7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ric1Q69ZJ7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms