Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sh3rf1Q69ZI1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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