Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pkp4Q68FH0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pkp4Q68FH0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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