Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Polr2kQ63871 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms