Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ift52Q62559 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms