Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5dQ62240 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5dQ62240 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms