Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sema4aQ62178 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Sema4aQ62178 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sema4aQ62178 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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