Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rbm38Q62176 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rbm38Q62176 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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