Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phox2aQ62066 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phox2aQ62066 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms