Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxj1Q61660 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxj1Q61660 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms