Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ecm1Q61508 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms