Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd1Q61345 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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