Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms