Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gbp4Q61107 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gbp4Q61107 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms