Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik1Q60934 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms