Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stxbp3Q60770 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stxbp3Q60770 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms