Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atf3Q60765 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms