Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Samhd1Q60710 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms