Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprnQ60673 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprnQ60673 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms