Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nr2f1Q60632 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nr2f1Q60632 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms