Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sin3aQ60520 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sin3aQ60520 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms