Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim38Q5SZ99 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim38Q5SZ99 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms