Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tsr1Q5SWD9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr1Q5SWD9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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