Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trappc1Q5NCF2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc1Q5NCF2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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