Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf3Q5HZG4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf3Q5HZG4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms