Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms