Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lrrc47Q505F5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc47Q505F5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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