Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Xirp2Q4U4S6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms