Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5935Q497S0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm5935Q497S0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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