Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx25Q3ZT31 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Snx25Q3ZT31 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Snx25Q3ZT31 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Snx25Q3ZT31 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx25Q3ZT31 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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