Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Carmil2Q3V3V9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Carmil2Q3V3V9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms