Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tmub2Q3V209 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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