Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc110Q3V125 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc110Q3V125 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms