Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ppp4r3cQ3V0Y1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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