Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4933416C03RikQ3V063 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms