Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc114Q3UX62 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms