Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm29609Q3UU56 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm29609Q3UU56 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms