Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fchsd2Q3USJ8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fchsd2Q3USJ8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms