Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28047Q3US59 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28047Q3US59 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms